Esse serviço contempla vistorias, emissão de notificações, embargos, autos de infração, interdições, apreensões e demais procedimentos que visem à cessação e/ou regularização de atividades que estejam infringindo as legislações ambientais. As fiscalizações são motivadas por denúncias ou pela verificação de irregularidades pelos próprios fiscais. As principais atividades fiscalizadas são: cortes de vegetação nativa; interferências em Áreas de Preservação Permanente (APPs); maus tratos aos animais; poluição atmosférica, hídrica, do solo, visual e sonora; terrenos sujos e atividades econômicas sem licença ambiental.