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O site do Ministério da Saúde e o aplicativo do ConecteSUS, que fornece o Certificado Nacional de Vacinação Covid-19, foram invadidos por hackers, na madrugada do dia 10 de dezembro. Desde então, o Sistema de Informação do Programa Nacional de Imunização (SI-PNI), uma das plataformas afetadas pelo ataque, encontra-se desatualizada. A página do ministério já voltou a funcionar, mas ainda não é possível acessar os dados sobre a vacina contra covid-19. Profissionais de saúde estão anotando em planilhas de papel a aplicação das doses de vacinas contra a covid-19 para posterior inclusão nos formulários online. Também foi afetado o e-SUS Notifica, que recebe notificações dos estados e municípios sobre a síndrome gripal suspeita e confirmada de covid-19.

Segundo o Ministro da Saúde Marcelo Queiroga, ainda que as informações não estejam completamente acessíveis para a população, o Ministério da Saúde continua recebendo os dados dos estados e municípios e realizando vigilância de qualidade. Equipes da Secretaria de Vigilância em Saúde (SVS) acompanham diariamente as notificações e realizam ações estratégicas de diagnóstico situacional in loco nos municípios. Isso acontece sempre que é registrada alta no número de casos e óbitos por três semanas epidemiológicas consecutivas.